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tengo una duda , yo tengo las clases ya del programa pero quiero hacr la conexion alguien me puede ayudar a realizarla o darme un ejemplo de como. gracias 

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Para conectarte a una base de datos tienes muchas maneras dependiendo del lenguaje de programacion que estes usando, por ejemplo en PHP exiten funciones especificas para conectarse con Mysql, en Java puedes usar JDBC, y en el resto de lenguajes (por lo menos en el resto que conozco yo) se usa ODBC.
Para PHP: http://es.php.net/manual/es/book.mysql.php
Para Java: http://www.mygnet.net/articulos/java/jdbc.770
Para ODBC te recomiendo que lo busques dependiendo del lenguaje asi te resultara mas facil entenderlo

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Es muy sencillo hacerlo a traves de cualquier lenguaje, con los programas propietarios como .net seria mejor hacerlo odbc, para java jdbc. de hecho puedes bajar uno de mis manuales de aqui mismo, que se llama Conexiones web.